Em meio às crescentes mudanças, avanços tecnológicos e científicos, a atuação em rede tem adquirido papel de extrema importância. Especialmente na área da saúde, a participação de instituições de ciência e tecnologia (C&T) em redes colaborativas permite combinar diferentes tipos de conhecimentos e competências para resolver problemas complexos, impulsionando não só a criação do conhecimento, mas também o processo de inovação. Assim, entende-se que para as instituições públicas de C&T que atuam nessa área, o mapeamento de suas redes de colaboração e a consequente organização de informações relevantes, que auxiliem na disponibilização de informações estratégicas, é de extrema importância na construção de um futuro alinhado a demandas sociais. Este estudo propõe um método de produção de informações estratégicas baseado em um conjunto de indicadores de redes de colaboração, com o intuito de subsidiar processos de planejamento estratégico e tomada de decisão em instituições de C&T em saúde. O conjunto de indicadores foi testado em duas instituições correlatas, Bio-Manguinhos e o Instituto Butantan, e foi capaz de fornecer informações que permitiram a avaliação das várias redes existentes nas organizações e a identificação de suas sobreposições e diferenças. Foi possível fornecer dados tanto no nível micro, gerando informações sobre cada indivíduo membro da rede, quanto no nível macro, de forma a adquirir conhecimento sobre a estrutura de cooperação institucional. Assim, na busca pela avaliação do comportamento colaborativo de instituições de C&T, esta tese contribui de maneira inovadora ao se utilizar da análise de redes como método de escolha para a produção de informações estratégicas.