As Boas Práticas de Transporte são um conjunto de requisitos de qualidade que orientam o processo de transporte de produtos para a saúde, incluindo os investigacionais, para que os padrões de qualidade apropriados sejam alcançados em todas as etapas do deslocamento. O transporte é a parte da logística responsável pelo deslocamento de produtos farmacêuticos por meio de vários modais existentes. As etapas dessa atividade primária influenciam diretamente na segurança e na eficácia dos medicamentos, devendo ser realizadas em consonância com a Legislação Brasileira pertinente à área, apesar de serem antigas e escassas. O monitoramento da etapa de transporte de um produto usado em pesquisa clínica é de fundamental importância, pois garante que os participantes dos estudos receberão o produto investigacional nas condições apropriadas ao uso, contribuindo para que a confiabilidade dos resultados do estudo clínico seja alcançada. O objetivo deste trabalho é avaliar e sistematizar as Boas Práticas de Distribuição no Transporte dos produtos investigacionais desenvolvidos em BioManguinhos para os Centros de Pesquisa Clínica, consolidando proposta de melhorias relevantes e assegurando a padronização de procedimentos. Dentro dessa perspectiva foi realizado um estudo de caso, com base em levantamento da literatura, na observação da atividade de transporte vigente e na coleta de informações por meio de banco de dados secundários, tais como relatórios de auditorias, rotas, abertura de desvios, registros de temperatura e umidade, análise de risco que permitiram como resultado final elaborar um Manual das Boas Práticas de Distribuição no Transporte considerando as especificações técnicas, regulatórias e éticas. Esse modelo pode ser também entendido como uma ferramenta para a inovação incremental de Bio-Manguinhos em gestão da qualidade e poderá ser adotado como referência na cadeia logística. Dessa forma, se mantém a qualidade dos medicamentos produzidos, tendo como principal foco as Boas Práticas de Distribuição no Transporte de Produtos Farmacêuticos e também as Boas Práticas de Fabricação como preconizada na RDC 17/2010.