Compartilhando suas notas de laboratório

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Por  e * - The Varsity   

 


FIONA TUNG/THE VARSITY

 

O Consórcio de Genômica Estrutural (SGC) lançou a Unidade de Ciência Extrema Aberta (EOSU) em janeiro para incentivar a colaboração científica. A iniciativa visa tornar a pesquisa transparente, promovendo a comunicação através da partilha de dados de pesquisa e notas on-line. Desde a sua criação, o banco de dados apresentou cientistas de todo o mundo.

O Dr. Matthieu Schapira, chefe do grupo de Informática de Pesquisa do SGC, fundador da EOSU e professor associado do U of T no Departamento de Farmacologia e Toxicologia, foi inspirado no blog do Dr. Rachel Harding, LabScribbles . Harding, um colega pós-doutorado no SGC, está carregando notas para o LabScribbles nos últimos dois anos, atualizando continuamente colegas cientistas em seu trabalho na determinação da estrutura da huntingtina, uma proteína ligada à doença de Huntington.

Atualmente, 12 cientistas contribuíram para a EOSU, e em breve outros oito estarão se juntando.

"Eu acho que isso promove colaborações; você evita a redundância de experimentos que outra pessoa provavelmente já tentou e acho que é apenas um meio de reunir a comunidade científica, o que é ótimo ", disse Mandeep Mann, aluno de mestrado no Departamento de Farmacologia e Toxicologia.

Uma das conseqüências da pesquisa é a quantidade de tempo que leva para que um estudo seja aceito, revisado por pares e publicado. O professor Aled Edwards, diretor do SGC, escreveu que "o tempo médio entre experiência e publicação ... é de um a dois anos. Isso é 67 por cento da vida útil média de um paciente com ALS ".

A rápida mudança de acesso aberto pode levar a um aumento na produção e acessibilidade da pesquisa.

bioRxiv, a resource available to scientists for feedback prior to journal submission, has seen an increase in the number of manuscripts uploaded to its database. Recently, bioRxiv published a study by Stanford University researchers, which found that the genome editing tool CRISPR-Cas9 could be ineffective in humans. While the research has yet to be peer-reviewed, it allows fellow scientists from around the world to also investigate the caveats of gene editing technology in light of these results.

Unlike literature published in journals, the quick processing and lack of the traditional peer-review process prior to publication may raise certain concerns over the quality of research and findings that are made available.

Harding, no entanto, esclareceu que "isso não é validado pelos dados de revisão pelos pares, este é um caderno aberto ... [e ele] deve ser lido com um chapéu diferente".

Em 2016, o Dr. Dan Longo e o Dr. Jeffrey Drazen levantaram preocupações em torno de "pesquisar parasitas" em um editorial no The New England Journal of Medicine .

"Obviamente, há reservas de" alguém vai ver isso e usá-lo em suas experiências e publicar algo e não me acreditar com isso ", disse Mann. "Eu acho que é um risco, definitivamente, mas é um tipo de ... um experimento por conta própria".

A Schapira espera que os riscos associados a um paradigma de "caderno aberto" sejam pequenos porque os dados publicados ainda estão em estágios experimentais iniciais. Tanto ele quanto Harding vêem o conceito de publicação aberta como uma oportunidade para se conectar com especialistas no campo. Obter informações diretas e opiniões variadas de um grupo maior de pessoas irão progredir em pesquisas e possíveis tratamentos médicos.

"Você pode criar estes ... ecossistemas em miniatura - onde você está trabalhando com outras pessoas no campo e você pode compartilhar dados ou recursos em estágios anteriores, então você pode mover a ciência para a frente de maneira mais rápida", disse Harding.

Apesar dos benefícios da ciência aberta e da colaboração, alguns cientistas continuam cautelosos com o movimento. Schapira acredita que o sentimento é justificado, dado que não é o modus operandi normal no campo biomédico.

"Se mantivermos uma mente aberta e um pouco de pensamento crítico, pode realmente nos ajudar a perceber que, de verdade, [ciência aberta] vem com oportunidades reais em termos de extensão da nossa rede, conexão com pares, geração de novas colaborações e progresso mais rápido ", disse Schapira.

*Texto publicado originalmente pelo jornal The Varsity

https://thevarsity.ca/2018/02/05/sharing-your-lab-notes/

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